飛凡檢測(cè): | 細(xì)胞鑒定 |
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發(fā)布時(shí)間: | 2023-12-17 11:20 |
最后更新: | 2023-12-17 11:20 |
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飛凡檢測(cè)張同學(xué)今天與大家淺聊一下STR,什么是STR呢?
STR即短串聯(lián)重復(fù)序列(Short Tandem Repeats),也稱微衛(wèi)星DNA(microsatellite DNA),是一段包含1-6bp的重復(fù)DNA序列。STR廣泛存在于原核動(dòng)物和真核動(dòng)物中,人類中也不例外,約占人類基因組的3%。由于其多態(tài)性和高突變率,STR在生物學(xué)研究中得到了廣泛的應(yīng)用,又被稱為細(xì)胞的DNA指紋。
由于STR技術(shù)的高靈敏度、自動(dòng)化程度高、準(zhǔn)確快速、重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn),STR基因分型已被作為金標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于細(xì)胞鑒定,由于細(xì)胞系交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí)而導(dǎo)致研究錯(cuò)誤、結(jié)果不可重復(fù)等情況的存在,建議在實(shí)驗(yàn)開(kāi)展前進(jìn)行細(xì)胞的STR鑒定分析。
細(xì)胞STR鑒定即通過(guò)STR信息建立細(xì)胞系的遺傳特性,通過(guò)STR鑒定來(lái)檢測(cè)細(xì)胞是否發(fā)生交叉污染或者誤認(rèn)的情況。STR 基因座位上的等位基因可通過(guò)擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列拷貝數(shù)的不同來(lái)區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過(guò)熒光檢測(cè)來(lái)識(shí)別。隨后通過(guò)一定的計(jì)算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。
STR(Short Tandem Repeat,短串聯(lián)重復(fù)序列)基因位點(diǎn)由長(zhǎng)度為3~7個(gè)堿基對(duì)的短串連重復(fù)序列組成,這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱為細(xì)胞的DNA指紋。 STR基因座位上的等位基因可通過(guò)PCR擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來(lái)區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過(guò)熒光檢測(cè)來(lái)識(shí)別,隨后通過(guò)一定的計(jì)算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與專業(yè)的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。那么STR的鑒定結(jié)果能說(shuō)明什么呢? STR的鑒定結(jié)果能證明以下問(wèn)題: 1. 是否為人源細(xì)胞;2. 是否為標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系;3. 是否存在物種內(nèi)交叉污染。為什么要進(jìn)行STR鑒定?據(jù)統(tǒng)計(jì),約18%~30%細(xì)胞系被交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí),使用該細(xì)胞可能導(dǎo)致研究錯(cuò)誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細(xì)胞治療災(zāi)難性后果等。 2009年起,NIH和ATCC呼吁研究者對(duì)細(xì)胞進(jìn)行STR鑒定并著手建立細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫(kù)。如今,細(xì)胞STR鑒定已是鑒別細(xì)胞身份及交叉污染的金標(biāo)準(zhǔn)。多數(shù)**期刊也要求作者投稿時(shí)提供細(xì)胞STR鑒定證明?!吨袊?guó)藥典》中明確規(guī)定,新建細(xì)胞系/株、細(xì)胞庫(kù)和生產(chǎn)終末細(xì)胞應(yīng)進(jìn)行鑒別試驗(yàn),以確認(rèn)為本細(xì)胞,且無(wú)其他細(xì)胞的交叉污染。